为了拓展协会工作范围，充分调动广大会员单位开展国防教育工作的积极性，经有关学校倡议及协会工作需要，报北京市教委、市社团办审批，于 2005 年 4 月在首都师范大学成立了定向运动分会；同年 7 月在国防大学成立了中专分会。

    二级分会是隶属北京高校国防教育协会的下设分会，定向运动分会的主要工作是组织协调高校开展定向运动的培训和比赛；中专分会的主要工作是协调中专学校开展经常性的国防教育活动。